Institutul Cantacuzino anunță că a reușit să descopere primele informații asupra întregului genom al virusului SARS-CoV-2 care circulă în România. Cercetătorii au constatat că virusul seamănă într-o proporție mai mare cu tulpinile care au circulat în mai multe țări europene, dar și în India sau SUA.
Coronavirusurile cuprind numeroase virusuri care pot determina infecții atât la animale cât și la oameni. La om, coronavirusurile provoacă infecții respiratorii, forme ușoare sau severe precum Sindromul Respirator din Orientul Mijlociu (MERS), sau Sindromul Respirator Acut Sever (SARS). Cel mai recent coronavirus a fost identificat pentru prima dată în China (orașul Wuhan, provincia Hubei) în decembrie 2019 și provoacă boala coronavirus COVID-19.
Infecția COVID-19 în România a fost raportată în data de 26 februarie 2020 prin confirmarea primului pacient cu SARS-CoV-2 prin rRT-PCR (reverse transcriptase–polymerase chain reaction), în următoarele 18 săptămâni înregistrându-se 15.501 cazuri confirmate și 966 decese .
Virionii corona au formă sferică şi cel mai mare genom dintre toate virusurile cu genom ARN (120-160nm în diametru), unitar, nu segmentat așa cum este al virusurilor gripale. Virionul corona este format din nucleocapsida cu simetrie helicală alcătuită din ARN și proteina N, acoperită de un înveliș (peplos) în care sunt inclavate glicoproteinele virale.
Genomul conține două cadre de citire la capătul (open reading frames, ORF), ORF1a și ORF1b, care codifică 16 proteine non-structurale (exp. ARN polimeraza ARN-dependentă, RdRp). La capătul al genomului se află genele care codifică cele 4 proteine structurale majore: glicoproteina S (proteina structurală a spiculilor care conferă virionilor aspectul caracteristic de coroană și permite virusului să pătrundă în celulele gazdă prin utilizarea enzimei 2 de conversie a angiotensinei, ACE2, ca receptor de intrare), proteina E (de înveliș), M de membrană (componentă minoră a peplosului) și proteina N a nucleocapsidei .
Cum funcționează coronavirusul
Coronavirusurile pot prezenta variabilitate genetică datorită mutațiilor apărute în genomul viral. Mutațiile genetice reprezintă erori de transcriere ale ARN-polimerazei care dispune de mecanisme de corectare (proof-reading) ineficiente (exp. încorporarea greșită a unei baze care poate duce la schimbarea mesajului unui codon), ceea ce permite reasortarea materialului genetic. Mutaţia poate genera noi variante antigenice și o variaţie limitată a potenţialului patogenic. Recombinarea, un eveniment mult mai rar, produce un virus nou, cu o nouă combinaţie de gene şi cu proprietăţi antigenice noi. Emergenţa unei tulpini virale noi este condiţionată de capacitatea sa de multiplicare şi de diseminare la organismele sensibile, iar apariția de epidemii sau pandemii depinde de capacitatea de diseminare a virusului (contagiozitate) .
În fazele incipiente ale epidemiei din România, sursa de infecție a fiecărui caz a fost identificată prin anchete epidemiologice amănunțite, urmate de detecția și izolarea/ carantinarea contacților. Odată cu răspândirea virusului în populația generală, această strategie nu mai poate furniza date exacte. Pe măsură ce virusul se răspândește, apar multiple oportunități de selecție naturală a unor mutații care pot avea impact major asupra transmisibilității virusului.
Secvențierea genomică oferă o alternativă de monitorizare în timp real a dinamicii transmiterii virale, prin identificarea unor secvențe care agregă împreună în clustere și corelarea lor cu datele clinice și epidemiologice.
Primele informații asupra întregului genom al virusului SARS-CoV-2 identificat în România, au fost obținute în Laboratorul Infecții Respiratorii Virale, Centrul Național de Gripă din Institutul Național de Cercetare-Dezvoltare Medico-Militară ”Cantacuzino”, prin utilizarea tehnologiei secvențierii de nouă generație (NGS) cu ajutorul sistemului de secvențiere Illumina MiSeq și a softului DNASTAR Lasergene, se arată în comunicatul publicat de cercetătoarea Mihaela Lazăr.
Citește și:
Lovitură! Cum a fost recompensat cu 10 milioane de euro denunțătorul fostului ministru Sorina Pintea
EXCLUSIV Dezvăluire-bombă: ‘Executat’ în timp ce era pe patul de spital, suspectat de coronavirus! ‘Am vorbit cu domnul Berbeceanu, sigur a ajuns la domnul Vela’
Schimbare fără precedent în sistemul de Educație! Guvernul transformă, pe timp de stare de alertă, elevii și părinții în profesori
